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Qi#原创作者专属任务#萼形柱珊瑚萼形柱珊瑚（Stylophorapistillata）是一种石珊瑚，学名又被称为猫爪爪俱乐部手指珊瑚（CatsPawClubFingerCoral），因其幼虫常常附着到其他生物上顺水漂流，也被称为“流浪珊瑚”。由于全球气象变化、水资源污染等因素，全球的珊瑚种群正在遭受着巨大的危机。因此，了解珊瑚、保护珊瑚成了维持海洋生态多样性必不可少的一环。年4月28日，来自西班牙巴塞罗那理工学院ArnauSebe-Pedros以及以色列海法大学TaliMass研究组在Cell杂志上合作发表题为Astonycoralcellatlasilluminatesthemolecularandcellularbasisofcoralsymbiosis,calcification,andimmunity的文章，通过单细胞测序的方式揭开了萼形柱珊瑚生命周期中40多种细胞类型的单细胞RNA-seq图谱，揭开了石珊瑚以及其藻类共生的新陈代谢程序、钙化过程以及免疫的分子和细胞基础。造礁石珊瑚，是礁石的主要建造者，构成多样化的海洋生态系统，提供了大约四分之一的海洋物种的栖息之地。尽管它们在生态系统的位置很重要，但一直以来大家对于造礁石珊瑚生物学的细胞类型和分子途径知之甚少。为了对萼形柱珊瑚细胞多样性进行研究，作者们对其3个生命阶段的单个细胞中进行取样，3个生命阶段分别是成虫石质群落、开始产生骨骼的初级息肉和非钙化的自由游动的幼虫（图1），所有的研究样品均采集自红海。图1萼形柱珊瑚的形态、进化上的位置以及生活周期在对组织进行机械解离后，作者们利用荧光激活细胞分选将单细胞分选到孔板中，并使用MARS-seq实验方法制备单细胞测序文库。随后作者对该文库进行了单细胞RNA-seq，并建立了整个组织的细胞类别图谱。进一步地，作者们通过利用Metacell算法对不同的细胞种类进行聚类和分析。总的来说，作者们在成年珊瑚中定义了37种转录不同的细胞类型，在初级珊瑚虫中定义了13种细胞类型，在游动的幼虫中定义了17种细胞类型，其中游动的幼虫中包含了大量未分化的细胞。随后作者们通过原位杂交的方式对不同表达的基因进行了检测，从细胞生物学角度对单细胞测序聚类图谱进行验证。该图谱可以通过珊瑚图谱（